La forma en que debes manejar la tasa de interés depende de la forma en que habrás de programar los pagos. Si vas a hacer amortizaciones mensuales, debes utilizar la tasa efectiva mensual; si vas a hacer amortizaciones trimestrales, la tasa debe ser efectiva trimestral, y así sucesivamente. La forma en que habrás de programar tus pagos o amortizaciones puede depender de dos cosas: la forma más recomendable sería programarlos dependiendo de la naturaleza del proyecto en cuestión, es decir, de la forma en que el proyecto genere flujos. Por ejemplo, hay proyectos que generan ingresos de manera regular y constante, en esos casos podría ser recomendable programar pagos mensuales, en caso de que el proyecto no genere ingresos regularmente, podría ser recomendable programar pagos trimestrales, semestrales o incluso anuales, todo va a depender de la forma en que genere ingresos cada proyecto. La otra cosa de la que depende la periodicidad con que se programen los pagos son los requerimientos de los bancos o instituciones de crédito; si el banco dice, mensual, pues habrías de considerar si el proyecto va a poder hacer pagos mensuales o de plano buscar otra institucion más flexible.
Respecto a lo que comentas sobre la diferiencia entre los intereses calculados cuando haces pagos mensuales y pagos anuales; pues sí, efectivamente si programas pagos anuales los intereses totales serán mayores, pero es debido a que, como amortizas o le abonas al capital solo anualmente, los intereses calculados en el año serán más altos. Cuando haces pagos mensuales, estás amortizando o abonando al capital más rapidamente, y como el capital está disminuyendo más rapidamente, esarás pagando menos intereses sobre saldos insulutos.
Espero que esto te sirva.
Suerte
